В первую очередь проверь расстановку перемычек и правильность развески устройств на шлейфах...
всё по стандарту, винт на мастере, сидюк на сингле
1. Приведи точную схему "развески" (Master-Slave, Primary, Secondary). Если устройства висят на одном шлейфе, BIOS может выставлять ограничеие скорости по минимальной (т.е. по CD-ROM'у!).
2. А на шлейфах они правильно висят? Центральный коннектор IDE-шлейфа - это Master. На некторых материнских платах неправильное подключение может вызвать тормоза.
3. Включен ли режим UDMA для CD-ROM'а?